一、植物總DNA提取設(shè)備配置，植物總DNA提取的所需的設(shè)備有：研缽、液氮罐、電熱恒溫水浴鍋、小容量離心機(jī)、大容量離心機(jī)、冰箱、紫外分光光度計(jì)等。
二、PCR反應(yīng)系統(tǒng)設(shè)備配置，一個(gè)實(shí)驗(yàn)室要能進(jìn)行PCR反應(yīng)實(shí)驗(yàn)，一般要具備以下實(shí)驗(yàn)設(shè)備：超凈操作臺(tái)、渦旋振蕩器、小容量離心機(jī)和PCR儀。由于PCR技術(shù)的提高，其對環(huán)境的要求也有所降低，所以為了方便，許多人做PCR反應(yīng)已不在無菌操臺(tái)上進(jìn)行了。盡管如此，超凈操作臺(tái)還是分子實(shí)驗(yàn)室不可缺少的儀器，有不少實(shí)驗(yàn)是須在超凈操作臺(tái)上進(jìn)行的。
三、凝膠電泳及顯色系統(tǒng)設(shè)備配置，凝膠電泳系統(tǒng)的主要功能是檢測提取的總DNA質(zhì)量及PCR擴(kuò)增產(chǎn)物。整個(gè)過程的完成需電泳儀、電泳槽、微波爐、搖床、膠盆、燈箱、紫外燈和一些常規(guī)的小件工具。
四、凝膠成像及數(shù)據(jù)處理系統(tǒng)設(shè)備配置，為了能觀察、記錄實(shí)驗(yàn)過程、長時(shí)間地保存實(shí)驗(yàn)結(jié)果以及對大量分子數(shù)據(jù)進(jìn)行處理分析，凝膠成像、圖像保存及數(shù)據(jù)處理系統(tǒng)是不可少的。對于分子植物育種實(shí)驗(yàn)來說，分子數(shù)據(jù)的獲得及分析是分子育種中非常核心的一步。只有對所得分子數(shù)據(jù)結(jié)合表型數(shù)據(jù)進(jìn)行充分詳實(shí)的分析，才能在實(shí)際育種中有更有效的運(yùn)用。這一系統(tǒng)主要包括凝膠成像系統(tǒng)、掃描儀、及各類生物應(yīng)用軟件。
五、其它的常規(guī)設(shè)備，分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)對實(shí)驗(yàn)操作環(huán)境及反應(yīng)溶液的條件要求很高。首先，是實(shí)驗(yàn)用水的水質(zhì)要好、純度要高。大部分實(shí)驗(yàn)用水都要求是超純水。因此需配置純水器和超純水器。其次，是無菌環(huán)境。離心管、Tip頭、一些配溶液的器皿以及不少溶液都需滅菌消毒。因而高壓滅菌鍋和烘干箱也是分子實(shí)驗(yàn)室必不可少的。很多的實(shí)驗(yàn)過程要始終在無菌條件下進(jìn)行，所以無菌操作臺(tái)是不可缺少的。再者，是溶液的取樣、pH值要準(zhǔn)確，溶液純度要高。故高精度的電子天平和pH計(jì)是配藥時(shí)所需的儀器，而磁力加熱攪拌器則是配的一個(gè)好幫手。還有移液器，它是一種準(zhǔn)確取樣的儀器，根據(jù)取樣量的需要，可選擇不同取樣大小的移液器分子。這就需要有良好的冷藏系統(tǒng)，一般分子實(shí)驗(yàn)室要具備4℃、-20℃的冰箱，條件較好的好有-70℃的超低溫冰箱。
六、易耗品，作為一個(gè)分子實(shí)驗(yàn)室，易耗品是相當(dāng)多的，在這里主要提到一些用量比較大的用品。首先，是手套。在實(shí)驗(yàn)室里，每當(dāng)接觸時(shí)，不管是否有毒，原則上都得戴上手套，所以手套的用量是相當(dāng)大的。其次，是Tip頭和Tip頭盒。Tip頭與移液器配套用于移取溶液、加樣等。還有離心管及離心管架，這些離心管須與實(shí)驗(yàn)室的離心機(jī)和PCR儀相匹配，而離心管架也得與離心管配套。玻璃板、梳子、膠條和夾子，這也要根據(jù)實(shí)驗(yàn)室的電泳槽而定，通常買電泳槽時(shí)會(huì)有配備一些，不過這些量一般是不夠的，還得自己另行購買。
